Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms