Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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