Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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