Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFFO1Q0D2I5 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms