Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CENPEQ02224 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms