Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms