Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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