Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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