Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FXNQ16595 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FXNQ16595 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms