Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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