Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms