Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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