Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3AQ14563 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3AQ14563 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3AQ14563 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3AQ14563 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3AQ14563 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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