Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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