Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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