Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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