Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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