Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms