Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms