Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1AQ13111 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms