Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFT88Q13099 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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IFT88Q13099 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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