Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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