Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms