Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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