Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CENPFP49454 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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CENPFP49454 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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CENPFP49454 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CENPFP49454 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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CENPFP49454 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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CENPFP49454 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CENPFP49454 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CENPFP49454 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CENPFP49454 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CENPFP49454 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CENPFP49454 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CENPFP49454 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CENPFP49454 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CENPFP49454 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CENPFP49454 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CENPFP49454 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CENPFP49454 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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