Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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