Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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