Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ARXQ96QS3 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ARXQ96QS3 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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