Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HSPB1P1-201ENST00000423240 256 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL596188.1-201ENST00000452888 370 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC005703.4-201ENST00000580422 538 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC111188.3-201ENST00000604663 307 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 NMNAT3-214ENST00000514703 584 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms