Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms