Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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