Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms