Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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SCN9AQ15858 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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SCN9AQ15858 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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SCN9AQ15858 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN9AQ15858 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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