Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USF2Q15853 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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