Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EEA1Q15075 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
EEA1Q15075 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms