Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms