Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NEDD9Q14511 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms