Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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