Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms