Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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