Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms