Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTP4A2Q12974 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms