Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms