Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms