Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms