Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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COL24A1Q17RW2 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
COL24A1Q17RW2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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