Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDKN3Q16667 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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