Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ATP6AP1Q15904 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ATP6AP1Q15904 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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