Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBE3CQ15386 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms