Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAM2Q15035 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms